بر طبق تحقیقات انجام شده در سال 2016 در مجله علوم (science magazine) ساختار مغز بین مردان و زنان متفاوت است، مغز مردان بزرگ‌تر از زنان است، بادامه مغزی مردان بزرگ‌تر می‌باشد که با احساسات و بقا و همچنین این منطقه از مغز با حافظه، هیپوکامپ چپ در ارتباط است که به‌طور معمول در مردان بزرگ‌تر از زنان است و در زنان و مردان دارای مقادیر مختلفی از ماده سفید و خاکستری می‌باشد.

با این حال مطالعات جوئل (Joel) که بر روی مغز 1400 زن و مرد انجام شد نشان داد بین هم‌پوشانی ساختار مغزی زنان و مردان بسیار زیاد است، اگرچه برخی از ویژگی‌ها در میان زن‌ها شایع‌تر بود و برعکس، مغز زنان و مردان متفاوت نبود، وی از این مطالعه نتیجه گرفت که اگرچه بین جنسیت تفاوت وجود دارد اما نمی‌توان به سادگی مغز را باعنوان‌هایی چون زن یا مرد طبقه‌بندی کرد، همچنین فرضیاتی که بیان می‌کنند بر اساس اندازه مغز مردها اساسا باهوشتر هستند اشتباه است. یک مطالعه ترکیبی که به‌وسیله ویر (Voyer) در سال 2015 انجام شده نشان می‌دهد که در نمرات مدرسه دختران نسبت به پسران دارای معناداری جزیی بیشتری می‌باشد. همچنین تحقیقات نشان نداده است که مردان و زنان به‌طور متفاوتی یاد می‌گیرند، پس گزینه درست می‌تواند گزینه 2 باشد.

به خاطر این‌که در جمعیت مردان نسبت به هم و در جمعیت زنان نسبت به همهمین‌طور جمعیت مردان و زنان نسبت به یکدیگر تفاوت زیادی وجود دارد، دلیلی وجود ندارد که محتوا بر اساس یادگیری متفاوت در زنان یا مردان طراحی گردد، در نتیجه نمی‌توان در مورد تفاوت در رفتار و یادگیری در زنان و مردان بر اساس تفاوت ساختار مغزی نتیجه‌گیری مفیدی کرد.